在归因与文化等社会认知的基础与应用研究领域，分别用中、日、英文在SSCI、中国和日本心理学期刊发表论文数篇与日文专著一部。同时围绕华人文化圈与东亚文化圈进行文化心理学的实证研究，并致力于进行东亚文化心理学的理论整合与建构。
在心理咨询与治疗的临床实践领域，在华东师范大学心理咨询中心与心理健康辅导中心有多年心理咨询与治疗经验，为华东师范大学心理健康辅导中心资深心理咨询师。咨询风格为精神分析取向。曾在日本京都大学精神分析方向访问交流两年（1995-1997年）。
主持科研项目：
1. 2016年度上海哲社规划项目一般课题：消费者的“群际归因偏好”的心理机制研究（项目基金号2016BSH002）。2016年7月-2019年6月。
2. 2012年度教育部留学回国人员科研启动基金项目：东亚文化心理学的理论建构。2012年9月-2014年8月。
3. 2010年度教育部人文社会科学研究青年基金项目：归因偏好的心理机制研究（项目基金号10YJCXLX034）。2010年7月-2013年6月。
代表性论文：
1. 马伟军, 陈振圻，吴雪, 冯睿, 杨安博，徐光兴. (2017). 心理咨询与治疗的三大流派. 中国社会科学报, 2017年6月23日第1233期.
2. 马伟军, 吴雪, 冯睿, 徐光兴. (2017). 精神分析取向心理治疗关注潜意识. 中国社会科学报, 2017年2月13日第1145期.
3. Ma, W.J., Feng, R.＊, Hu, R., Xi, J.Z., Fox, E., & Ding, X. (2016). Toward the theoretical constructs of East Asian Cultrual Psychology. In C. Roland-Lévy, P. Denoux, B. Voyer, P. Boski & W. K. Gabrenya Jr. (Eds.), Unity, diversity and culture: Research and Scholarship Selected from the 22nd Congress of the International Association for Cross-Cultural Psychology (pp. 32-36). Melbourne, Florida USA: International Association for Cross-Cultural Psychology. Accessed via www.iaccp.org. ( ＊the joint first authors and corresponding author)
4. 马伟军, 冯睿＊, 席居哲, 陈滢滢, 梅凌婕. (2015). “差序格局”的心理学记忆视角的初步验证. 心理学探新. 35(6), 514 - 519. (＊通讯作者)
5. 马伟军, 冯睿. (2012). 中国大学生的自我建构、利己归因偏好与自我增强.心理科学, 35(6), 1398-1403.
6. 马伟军. (2011). 共变信息的程度差异对归因的影响. 心理科学, 34(6), 1469–1475.
7. 马伟军. (2010). 一种共变信息在原因维度中的归因. 心理科学, 33(4), 891–895.
8. 马伟军. (2009). 群际归因偏好研究综述. 心理科学, 32(4), 908-909.
9. Ma, W.J. & Karasawa, M. (2006). Group inclusiveness, Group identification, and Intergroup Attributional Bias. Psychologia, 49(4), 278-290.（SSCI）
10. 馬偉軍. (2003). 中国人の帰属における自己奉仕的傾向と集団奉仕的傾向. 日本社会心理学研究, 19(2), 135-143. (日本語)
著作：
马伟军著‚「原因帰属における情報処理モデルとバイアス」（日文）（中文名：《归因的情报处理模型与偏向》）‚日本三惠社出版社‚2011年8月
