微生物学是生命科学领域中的基础支撑学科，是食品科学与工程、食品质量与安全、生物工程、发酵工程、制药工程、药物制剂及轻工纺织食品类其它相关专业的主干基础技术课，是重要的学科基础课之一。它有其独特的研究方法和实验操作技术，这些方法与技术，在食品、发酵、生工、医药、化工、农业、畜牧业、纺织、皮革、造纸、能源、石油、环保等方面日益发挥着重要的作用。食品微生物学是微生物学应用学科中重要的一门分支学科，专门研究与食品有关的微生物的种类、特点及其在一定条件下与食品工业关系的科学，是食品科学学科专业的一门专业基础课。该课程是在细胞、分子或群体水平上研究微生物的形态构造、营养与培养、生理与代谢、遗传变异、生态分布和分类进化等生命活动基本规律，并将其应用于食品工业的科学。其根本任务是发掘、利用和改善有益微生物，控制、消灭或改造有害微生物。通过本课程的学习，使学生掌握微生物学的基本原理、操作技术及其在食品领域的应用知识，为今后进一步学习相关领域的专业课程或从事与微生物相关工业生产管理及相关领域的工作打下坚实基础。
   本课程由两部分组成，第一章到第六章为基础微生物学方面知识介绍，包括微生物的生物学特性、形态结构特征、生长繁殖特性、营养与代谢规律、生态分布规律、遗传变异与育种等；第七章到第十章为应用方面知识介绍，主要介绍有益微生物在食品工业中的应用、有害微生物污染食品及其腐败变质、食物中毒和食源性疾病等。