本门课程分为两部分，一部分为生物制药设备，一部分为分离纯化技术。

生物制药设备教学内容可分以下内容：1、细胞预处理的设备；2、萃取分离设备；3、吸附设备；4、凝胶、离子交换和亲和层析设备（吸附设备的发展）。

分离纯化部分共计12章，教学内容可分为3个层次，第一个层次（第1章）讲述生物药物的种类、分类和工艺基础，这章内容贯穿整门课程，需要学生认真学习；第二个层次（第2-9章）讲述各种纯化分离技术；第三个层次（第10-12章）则讲述纯化分离技术在各类生物药物制备中的应用（蛋白质类、酶类、糖类、抗生素等。

各种生物分离设备的讲授将穿插在相应的分离纯化技术的教学中。